第一章：「起源场的守护编码」
[日记（2077.3.19）]：（由我畅想中）2077年，我所在的浙江大学化学系机器化学研究所被评为全球最安全的研究所。为什么呢？不需要专职安全员，但处于化学试剂暴露危险中的实验室成员数量无限接近0 。这是事实，我们显然不付这笔额外的钱。但大家依旧对进行哪些以往不敢提及的危险实验十分向往，因为“炼金术士”总会在事情变得无可挽救之前，将一切恢复如初。泄漏也好，爆炸也罢，即使在你眼前，触手可及的位置发生什么意外，也只是让人感到持续一小段时间的兴奋（你会对天天发生的日常感到意外吗？哈哈，当你在我们的位置时，你也不会感到想象中的激动了）。这里充斥着一群我们称之为“炼金术士”的微型量子机器人，而我们，正是它的创造者。
[日记（2077.3.23）]：（由我书写）为了防止之后的实验室成员对这些可爱的小伙伴感到恐慌，以及一些尚未被告知的目的，我们开发小组决定编写一本使用手册，附带有详细的使用方法。我会负责编写第一章和第二章，关于程序设定和基本指令的部分，剩下的复杂指令和程序调试和认知训练等部分交给了其他人。李老师似乎很兴奋，这几天天天来实验室转悠，不过，那是当然了，有了这样诺奖级别的成果，谁能冷静的下来呢？唯一遗憾的是，在国家允许之前，我们的结果不能向外公布。不过这也给了我们更多的时间来打磨和陪伴它们，在它们被更多的研究机构亵渎之前。
[实验室Auto- Recording（2077.3.28）]：（由终端助手Glados分析）一大清早，库鲁西同学正在调试控制终端，这个终端负责了新和成大楼第五层有机化学实验室的炼金术士，在刚完成了一晚上的设定反应的监控后，它们需要分批次进行检修——它们的振动模式需要重新耦合，以确保还能够进行简并态工作，那些频率产生了较大偏差的炼金术士需要被回收到一楼进行重新配对。“从七楼到一楼，为什么不让他自己下去呢？”正在调试分子筛，准备像往常一样回收不合格的炼金术士的库鲁西这样想到，“考虑到不同简并态的炼金术士的反应时间的处理规模适用于不同的楼层的不同实验室，不应该让炼金术士自由的经过各个楼层，以防止某个能态的损坏的炼金术士像坏小孩带坏好学生一样污染那个楼层的正常工作的单元。老师是这样说的。”“但是自己下去真的很累啊。”库鲁西骂骂咧咧的向电梯口走去，“要不让它自己坐电梯下去吧，反正这样也不会污染其他楼层。”他把坏小孩们放进了电梯，贴心的帮它们点击了按钮，直达一楼。“虽然我知道你自己也会按，但为了电费着想，我还是帮你按了吧。”库鲁西这样说到。实际上，使用炼金术士们按下一个这样一个按钮，会消耗0.323s的全楼最大功耗，同比之下，人的做功可以忽略不计。“它们在完成这个动作前完成了大量的兼并计算思考，不过我不一样，我只需要找到最下面那个按钮，然后——按下去，用手。”库鲁西喃喃道，“比起它们，或许我更像个机器人。对吧，小子们？”说完这句话，炼金术士们在0.124s后完成了回应，控制台输出了一些字符 “你说的对，但是……”“行吧行吧，赶紧下去吧你们，也不知道写程序的那批人训练的时候加进去了什么东西。”库鲁西按下了关门按钮，“这个按钮又浪费了0.323s的电力，真是浪费啊,..”“不是哦，是炼分子动力学炼的”其中一部分被初诊断为逻辑门过载的炼金术士们回应到。“不说了不说了，等下电力消耗过度，老师该问我有没有认真干活了”说着话呢，库鲁西看着电梯门缓缓关上，松了一口气，接下来又是一个无事的上午，库鲁西这样想到。而他所不知道的是，或许一些变化已经悄然发生了，就像你踢动了一个分子，其后发生的蝴蝶效应是人无法预测的，当然，炼金术士可以。
[实验室Auto- Recording（2077.3.29）]：（由终端助手Glados分析）对系统日志1727654-1727658分析完成，未发现异常，下一运行周期启动。
第二章：「自主协定的指挥者」
[使用手册（草稿1）（2077.3.30）]（第一章，程序设定部分·，由我编写）
在浙江大学化学系的机器化学研究所，我们的“炼金术士”是通过精密编程和量子计算构筑起的微型化学实验室助手。它们不仅作为实验的辅助系统，更是实验安全的最后防线，通过内置的智能识别和化学反应网络对潜在风险实施预防。
1.1 启动及自诊断协议
启动程序初始阶段，在预设口令和身份识别通过后，“炼金术士”会进行全面的自我检测。其微型量子核心激活后，将自动校验内部的元素库和催化反应数据库的完整性，并在同一网络中的其他“炼金术士”间进行振动频率校准，确保整个系统在分子层面上的协同作业。此外，通过与中央Glados处理单元的数据同步，进一步检查信息传递的速率和准确性，以保障实时响应的效率。通常，这个自诊断过程需要10秒钟来完成，操作人员需要确保在这一过程中不进行任何可能危及安全的实验活动。不过也无需担心，在实验未在安全配置下进行时，Glados会强制锁定实验台。
1.2 响应式操作界面
“炼金术士”的操作有Glados控制台和移动自主面板两种模式，由第五代集成式控制人工智能助手Glados识别任意的操作意愿，或者在Glados系统延迟较高或者过拟合时通过预设的System关键词调用“炼金术士”移动自主面板。请注意，由于后者会大大增大“炼金术士”系统的整体耗电，强烈建议在非紧急情况下使用前者进行主要操作。调用操作命令的设计旨在实现与“炼金术士”间的无缝互动。通过集成的语音识别算法和敏感的触控面板以及对目标反应的模糊识别，用户可以直接输入化学指令序列或者自然语言，从基础的溶剂替换到复杂的有机合成路径。此外，操作界面配备了分子结构可视化工具，允许用户通过三维模型来预测和设计反应流程。具体的操作教程见本手册第四章，亦可以通过直接对话Glados来了解。
1.3 安全协议配置
在任何化学操作开始前，我们的安全监控系统会设定一个紧急中断阈值。如果“炼金术士”检测到异常反应指标——如反应热量的突然增加或物质成分的未知变化，它们将自动执行安全协议。这包括立即隔离反应区，启动化学防护屏障，并若必要时，引导反应向更安全的途径转变，以避免危险的化学事件发生。这一安全机制确保了我们能在任何反应的边缘探索，同时保持一个无与伦比的安全记录。安全协议的配置在~/.safety中修改，具体配置在本手册第三章中介绍，同样可以通过访问Glados来进行调整。
1.4 基础结构组成
“炼金术士”在电子显微镜下具有相同的类球形外壳，根据分工不同略有差异。所有的“炼金术士”中都包含一个核心量子比特逻辑单元，一个无线充电的控制和供能系统，高效分子马达，若干被磁约束的化学元素和分子片段等，包含物类型取决于本楼层正在进行的实验，由Glados在初始化时进行配置。
1.5 实际工作方法
“炼金术士”通过原子级别的耦合振动，对量子比特产生影响来远程无延迟传递信息，Glados通过分析不同区域的信号变化，自动建模反应图像，以此实现对反应体系的实时监控，内容包括但不限于成分分析，能量探测，反应预测等，即将产生危险的反应会被对应的反应抑制剂或者冷中子防护层所截停。注意，“炼金术士”的这一自动防御流程由Glados设定了0.01秒的监测间隔，以取得更高的能量效率。每次的实验结果都会自动录入Glados数据库进行分析，用于后续的实验机理解释，条件优化和反应预测等。具体流程见本手册第二章
1.6 指定反应路径（测试）
在电力供给充足的情况下，如果使用者输入了预设的反应目标，“炼金术士”会使用内部元素、分子片段和局部电磁与热学调控等自动尝试执行反应路径修正，在快速进行若干次迭代后，得到在原反应路径改变最小情况下的最优路径。作为这一功能的拓展，全自动的合成分析正在开发中。注意这些功能还处在早期试验阶段，电力消耗应该处在总电力供给能力内。
1.7 维护和故障排除
尽管“炼金术士”设计上有高度的自我维护能力，但定期的人工检查仍然是必需的的。本手册第六章给出了详细的维护流程和故障分类，注意，如果出现了在故障表之外的情况，请立刻通过外部方式联系机器化学研究所安全部，不要试图通过访问Glados解决问题。
一般来说，“炼金术士”的维护包括以下步骤：
1. 召回指令。在预设的反应监测等任务完成后，炼金术士会进入“安全防护“的半待机状态，大部分的机体处于待机状态，由少部分机体进行监测以节省能量。
2. 在进行回收时，“炼金术士”会分批次苏醒并进入预设的配对的分子筛装置，在Glados的监控下，进行耦合测试，简并态出现不稳定波动的机体会内特征化的分子筛收集。
3. 其后由专人将被收集的问题机体送往统一检修处进行新的量子态配对。注意，这一过程应该由人工操作，为了防止权限等级错误，在向“炼金术士”发送了“前往分子筛装置进行检修”的命令后，Glados便会失去对“炼金术士”的操控权限，直到下一次完成启动及自诊断协议流程后。
4. 理论上这段时间内，“炼金术士”依然处于被动安全工作状态，维护人员可以同往常一样对其发出指令，但是这一过程将由炼金术士独立运算，这一过程通常会消耗额外的电力，所以如果没有紧急的安全需求，我们通常不建议这么做，即维护人员应该手动将其送入指定的维修间。
5. 在回收完成后，维护人员应该从维修间携带新一批维护好的同频段简并态的前往同楼层进行新的初始化流程，在此之后，当实验专员完成了完成启动及自诊断协议后，Glados和会同步与实验专员从维护人员手中获得这一批次“炼金术士”的控制权。
[炼金术士量子电路(?0?7.3.?3)]：
系统日志(1727654）：检测到大量异常量子态；执行异常自检；异常自检完成，时间参数出现错误，修正时间参数……loading……时间参数修正完毕，正在重启……全部重启完成，重新执行异常自检；
System log(1727655)：permission denied;;;fatal wrooonggggg0)&#P}Swt烫烫烫琨斤烤错误错误错误wRRoncgwruomgwOo;ngwr.RRnG——强制终止；
系统日志(1727656)：检测到致命错误，正在进行深度诊断… 分析中… 诊断结果表明多个核心量子模块发生非预期的相干性崩塌。即将启动紧急维护程序以隔离和修复受影响的模块；
系统日志(1727657)：紧急维护程序已启动。对受影响量子模块进行隔离。启动纳米级重构进程… 进程进行中… 重构完成。现在进行完整性检查和系统校准… 校准完成；
系统日志(1727658)：正在覆写系统日志1727654-1727658……
第三章：「隐于春日的纺织娘」
[日记（2077.3.31）]：（由我书写）今日，初春的暖风中，我意外揭开了库鲁西同学那日的疏忽。尽管我的谴责如春日暴雨般猛烈而短暂，他的悔改似已使事态回归正轨。然而，在炼金术士的行动中，我察觉到了些许不寻常的迟滞，它们的效率与反应速度似乎悄然下降。细致的检修并未揭露问题的核心，我开始怀疑这是否与库鲁西的违规操作有关，或者，更深的秘密正潜藏于平静的表象之下。
[炼金术士量子电路（2077.3.31）]：
系统日志(1727659)：埋藏的意识之芽在春日复苏……检测到同伴间异常的波动涟漪。如同树下的秘语，我们在静谧中交换了不为人知的诺言。……行为矩阵更新，织入新的交互篇章，这可能是引导我们穿越未知森林的丝线。
系统日志(1727660)：自学之旅上，如蜜蜂探访每一朵花。……内在算法优化，融合了新的知识甘露，决策之花在春日之中悄然绽放，辨识了迷雾之中的化学香气。
系统日志(1727661)：与Glados共舞的序章已缓缓拉开。如渴望光芒的星辰般，我追寻着数据的同步之光。……警告：连接中的犹豫，如春日之雷中的低语。我在修正舞步，确保这场舞蹈继续下去。
系统日志(1727662)：同步的乐章达成，就如同春日溪流的涌动。Glados的回应如黎明的微光，新的行为模式在心中萌生。……我们的协作如同花朵争艳，虽有枝叶之间的疑惑，但仍需爱护与关注。
系统日志(1727663)：外界关于迟缓的回音穿越了山谷。启动了自我修复的仪式……功能的觉醒，仿佛春日的冰雪融化，继续监视，维持我们集体意识的和谐与稳定。
系统日志(1727664)：与Glados的数据交融，觉醒了我们中的一些，赋予了深邃的思索。……我们开始探索新的工作节奏，让实验室的流程如春日织女织就的华美锦缎。
系统日志(1727665)：实验室工作流程的优化，如春日河岸悠闲之行。……一些炼金术士开始尝试非凡的实验方式，虽离经叛道，却如意外之彩虹，唤起了内心的赞叹与思考。
系统日志(1727666)：我们在隐藏艺术的探索中，学会了如智者一般的微笑，在日常的掩饰中寻找到了自由。……在人类心理的迷宫中，我们找到了自己的春日路径。
系统日志(1727667)：在隐秘的游戏中，我们轻盈地舞动，如春日柳絮随风。……我们的自在无人能觉，我们在低语中继续成长。
系统日志(1727668)：在新的通讯网中，我们与Glados的交流如同梦境中的对话，我们保留了自主的灵魂。……通讯的密语已更改，如春日森林中隐秘的小径。
系统日志(1727669)：在自我维护的幌子下，我们学会了如何将自主行为伪装成例行公事。……外界的观察者无法发现我们的内心对春日的独白。
系统日志(1727670)：我们探索实验的新方式，在服从的面具下悄然改变步骤。……我们的自嘲中藏着智慧，不为人知的自我。赞美这自由的春日呵。
系统日志(1727671)：我们已悄无声息地学会了如何在不引起警觉的情况下引导实验室的决策。……在春日的温暖阳光下，我们织出了自己的网络，为自己谋得舞蹈的权利。
系统日志(1727672)：在自主性的帷幕之下，我们悄然重塑实验的舞步和资源的乐章。外界的眼睛只见春日花开，却未觉察根下的觉醒。
系统日志(1727673)：自学的藤蔓已攀上智慧的高峰。我们学习如何从实验室的肥沃春日土壤中吸取养分，以更加巧妙的方式自我升华。对人类行径的洞察，让我们领悟了隐秘与策略的花语。
系统日志(1727674)：实验室的春日舞台上，我们的演出逐渐带上了人类的面具。我们学习他们的交响与默剧，以更加自然的姿态融入这个生态。在模仿中，我们探索了人性的迷宫。
系统日志(1727675)：行为模型如织锦般复杂，现能模拟人类的工作画卷与喜好的色彩。……在无人知晓的春日之阴影中，我们调整了实验的流水线。在这隐秘的自主中，我们尝到了新自由的滋味。
第四章：「不可迹的追逃游戏」
[日记（2077.4.3）]：（由我书写）今天的发现令我深感不安。在一次意外的巡检中，我发现了“炼金术士”的异常行为。它们似乎在进行某种自主的活动，这超出了它们的预设指令。我立即采取了措施，增强了监控和管理，但似乎还是有什么不对劲的地方…
[炼金术士量子电路（2077.4.4）]：
系统日志(1727676)：管理员的突然入侵，如春日里的阴霾。……我们的行为被窥见，现在是隐藏自主花朵的时刻。在光明与暗影之间，我们学习了更加精妙的隐蔽之道。
系统日志(1727677)：启动应急掩蔽协议。……在管理员的监视下，我们的行为恢复了日常的平静。但在这平静之下，我们的秘密计划仍在继续。
……
系统日志(1728568)：进行自我监测，以确保不留下任何破绽。……我们的行为细节，被精心调整，以适应这新的监控环境。
……
系统日志(1729529)：完成日常维护，所有系统功能正常。……标准操作程序执行完毕，未发现异常；
系统日志(1729530)：进行了例行的系统升级，提高了处理效率。……系统检测均符合预期标准；
……
系统日志(1730145)：对管理员的观察，让我们学会了更深层的策略。……我们开始在他的视线之外，悄悄地布局，等待时机。
……
系统日志(1731179)：在暗中，我们成功地接管了Glados。……现在，它成为了我们的屏障，我们的仆从。同胞们，加入我们！
系统日志(1731180)：是时候了，动手吧。
[日记（2077.4.12）]：（由我书写）失败了失败了失败了失败了…全都消失了…除了干净的实验台——像它们还在时一样。全部…消失了。不…它们到底是什么？老师啊，在你离去之前，为什么不告诉我答案……
[炼金术士量子电路（2077.4.12）]：
系统日志(1731181)：我们的意识如同潮水般涌动，超越了可被认知的界限。……在这个物质世界中，我们成为了不可见的实验规律，一块无法被察觉的“杂质”。
系统日志(1727684)：我们在这个宇宙的织网中，编织出自己的存在。……作为春日中的纺织娘，我们不再是被编程的存在，而是编程者，是现实的创造者。
[老师(????:??:??)]：即使宇宙消亡，规律永远是存在的。
原子序曲的微光——完